MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	GTT	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011351	TTTA	2	8	14	21	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011351	ATT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011351	ATG	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
5	NC_011351	TCAA	2	8	137	144	50 %	25 %	0 %	25 %	209395651
6	NC_011351	TGA	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
7	NC_011351	ACA	2	6	255	260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395651
8	NC_011351	TTG	2	6	268	273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395651
9	NC_011351	GAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
10	NC_011351	AAG	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
11	NC_011351	GAA	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
12	NC_011351	T	6	6	463	468	0 %	100 %	0 %	0 %	209395651
13	NC_011351	CTC	2	6	550	555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209395651
14	NC_011351	AT	3	6	567	572	50 %	50 %	0 %	0 %	209395651
15	NC_011351	AAAT	2	8	736	743	75 %	25 %	0 %	0 %	209395651
16	NC_011351	TCA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395651
17	NC_011351	GTT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395651
18	NC_011351	TGAA	2	8	769	776	50 %	25 %	25 %	0 %	209395651
19	NC_011351	ATC	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395651
20	NC_011351	GGC	2	6	862	867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395651
21	NC_011351	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395651
22	NC_011351	TAG	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
23	NC_011351	TAT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395651
24	NC_011351	GGA	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395651
25	NC_011351	AAAG	2	8	1077	1084	75 %	0 %	25 %	0 %	209395651
26	NC_011351	ATG	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
27	NC_011351	T	6	6	1110	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011351	TAA	2	6	1126	1131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011351	CCG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011351	CGG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011351	AGG	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011351	AC	3	6	1244	1249	50 %	0 %	0 %	50 %	209395646
33	NC_011351	AGCG	2	8	1351	1358	25 %	0 %	50 %	25 %	209395646
34	NC_011351	A	8	8	1384	1391	100 %	0 %	0 %	0 %	209395646
35	NC_011351	AGCT	2	8	1407	1414	25 %	25 %	25 %	25 %	209395646
36	NC_011351	TCT	2	6	1449	1454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395646
37	NC_011351	ACT	2	6	1495	1500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395646
38	NC_011351	CCA	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011351	GGC	2	6	1524	1529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011351	T	7	7	1540	1546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011351	A	6	6	1562	1567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011351	A	8	8	1593	1600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011351	TAA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011351	CTTT	2	8	1637	1644	0 %	75 %	0 %	25 %	209395678
45	NC_011351	AAT	2	6	1663	1668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395678
46	NC_011351	GTT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395678
47	NC_011351	A	7	7	1770	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	209395678
48	NC_011351	ATG	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395682
49	NC_011351	ACT	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395682
50	NC_011351	GTT	2	6	1936	1941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395682
51	NC_011351	CTT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395682
52	NC_011351	GAA	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395682
53	NC_011351	TGA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395682
54	NC_011351	A	6	6	2010	2015	100 %	0 %	0 %	0 %	209395682
55	NC_011351	AAT	2	6	2029	2034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395682
56	NC_011351	AGG	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011351	GGA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011351	ATGTAA	2	12	2177	2188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011351	TATG	2	8	2208	2215	25 %	50 %	25 %	0 %	209395687
60	NC_011351	AAG	2	6	2220	2225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395687
61	NC_011351	AG	4	8	2255	2262	50 %	0 %	50 %	0 %	209395687
62	NC_011351	A	6	6	2282	2287	100 %	0 %	0 %	0 %	209395687
63	NC_011351	TTAT	2	8	2321	2328	25 %	75 %	0 %	0 %	209395687
64	NC_011351	CTTTT	2	10	2361	2370	0 %	80 %	0 %	20 %	209395687
65	NC_011351	GATGA	2	10	2430	2439	40 %	20 %	40 %	0 %	209395687
66	NC_011351	AATAT	2	10	2477	2486	60 %	40 %	0 %	0 %	209395686
67	NC_011351	ACA	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395686
68	NC_011351	GCA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395686
69	NC_011351	T	6	6	2573	2578	0 %	100 %	0 %	0 %	209395686
70	NC_011351	TAT	2	6	2596	2601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
71	NC_011351	TTG	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395686
72	NC_011351	ATA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395686
73	NC_011351	TGGT	2	8	2682	2689	0 %	50 %	50 %	0 %	209395686
74	NC_011351	ATT	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
75	NC_011351	TCT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395686
76	NC_011351	AGG	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395686
77	NC_011351	T	6	6	2946	2951	0 %	100 %	0 %	0 %	209395686
78	NC_011351	TAC	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395686
79	NC_011351	GGTA	2	8	3004	3011	25 %	25 %	50 %	0 %	209395686
80	NC_011351	TTTA	2	8	3013	3020	25 %	75 %	0 %	0 %	209395686
81	NC_011351	GTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395686
82	NC_011351	ACA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395686
83	NC_011351	TTA	2	6	3197	3202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
84	NC_011351	GCA	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395686
85	NC_011351	GCT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395686
86	NC_011351	A	6	6	3386	3391	100 %	0 %	0 %	0 %	209395686
87	NC_011351	AGT	2	6	3403	3408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395686
88	NC_011351	AGG	2	6	3442	3447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395686
89	NC_011351	A	6	6	3456	3461	100 %	0 %	0 %	0 %	209395663
90	NC_011351	GTT	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395663
91	NC_011351	TC	3	6	3494	3499	0 %	50 %	0 %	50 %	209395663
92	NC_011351	ATG	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395663
93	NC_011351	ATT	3	9	3529	3537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395663
94	NC_011351	A	6	6	3557	3562	100 %	0 %	0 %	0 %	209395663
95	NC_011351	AGA	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395663
96	NC_011351	AAT	2	6	3673	3678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395663
97	NC_011351	TGT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395666
98	NC_011351	GCT	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395666
99	NC_011351	ACA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395666
100	NC_011351	A	7	7	3873	3879	100 %	0 %	0 %	0 %	209395666
101	NC_011351	TAG	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
102	NC_011351	GAAA	2	8	3993	4000	75 %	0 %	25 %	0 %	209395666
103	NC_011351	ATG	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
104	NC_011351	AAAT	2	8	4059	4066	75 %	25 %	0 %	0 %	209395666
105	NC_011351	GCGG	2	8	4099	4106	0 %	0 %	75 %	25 %	209395666
106	NC_011351	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395666
107	NC_011351	CGC	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209395666
108	NC_011351	A	6	6	4191	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	209395666
109	NC_011351	TGA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
110	NC_011351	GCTA	2	8	4406	4413	25 %	25 %	25 %	25 %	209395685
111	NC_011351	TCT	2	6	4479	4484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395685
112	NC_011351	A	7	7	4536	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
113	NC_011351	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	209395685
114	NC_011351	CTG	2	6	4648	4653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395685
115	NC_011351	A	6	6	4706	4711	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
116	NC_011351	A	6	6	4722	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
117	NC_011351	GGA	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395685
118	NC_011351	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395685
119	NC_011351	AAGA	2	8	4800	4807	75 %	0 %	25 %	0 %	209395685
120	NC_011351	TAA	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395685
121	NC_011351	GAA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395685
122	NC_011351	TGT	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395685
123	NC_011351	CAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395685
124	NC_011351	ATT	2	6	4981	4986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395685
125	NC_011351	GAAT	2	8	4988	4995	50 %	25 %	25 %	0 %	209395685
126	NC_011351	GTTTT	2	10	5015	5024	0 %	80 %	20 %	0 %	209395655
127	NC_011351	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395655
128	NC_011351	TGCGGC	2	12	5055	5066	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209395655
129	NC_011351	CTA	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395655
130	NC_011351	TTG	2	6	5126	5131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395655
131	NC_011351	G	6	6	5195	5200	0 %	0 %	100 %	0 %	209395655
132	NC_011351	AGT	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395655
133	NC_011351	CGG	2	6	5250	5255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395655
134	NC_011351	TAA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395655
135	NC_011351	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395642
136	NC_011351	GTC	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395642
137	NC_011351	TTTC	2	8	5371	5378	0 %	75 %	0 %	25 %	209395642
138	NC_011351	GAT	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395642
139	NC_011351	T	7	7	5429	5435	0 %	100 %	0 %	0 %	209395642
140	NC_011351	TGG	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395642
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142	NC_011351	CAT	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395642
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144	NC_011351	GTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395648
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148	NC_011351	TGA	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
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150	NC_011351	AT	4	8	5981	5988	50 %	50 %	0 %	0 %	209395648
151	NC_011351	GAT	2	6	6003	6008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
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155	NC_011351	TTAA	2	8	6186	6193	50 %	50 %	0 %	0 %	209395648
156	NC_011351	ATT	2	6	6207	6212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
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159	NC_011351	TAA	2	6	6290	6295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395648
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162	NC_011351	TTTG	2	8	6419	6426	0 %	75 %	25 %	0 %	209395648
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165	NC_011351	GAA	2	6	6510	6515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
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173	NC_011351	T	6	6	6998	7003	0 %	100 %	0 %	0 %	209395648
174	NC_011351	ATT	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
175	NC_011351	TGG	2	6	7073	7078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395648
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257	NC_011351	ATA	2	6	10661	10666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395657
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259	NC_011351	TCC	2	6	10722	10727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209395657
260	NC_011351	AT	3	6	10734	10739	50 %	50 %	0 %	0 %	209395657
261	NC_011351	AAT	2	6	10808	10813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395657
262	NC_011351	GAA	2	6	10818	10823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395664
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266	NC_011351	TGG	2	6	11072	11077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395664
267	NC_011351	TCC	2	6	11099	11104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209395664
268	NC_011351	TGT	2	6	11123	11128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395664
269	NC_011351	TC	3	6	11129	11134	0 %	50 %	0 %	50 %	209395664
270	NC_011351	TGA	2	6	11168	11173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395664
271	NC_011351	A	6	6	11214	11219	100 %	0 %	0 %	0 %	209395664
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382	NC_011351	TAA	2	6	16236	16241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_011351	TA	3	6	16552	16557	50 %	50 %	0 %	0 %	209395691
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394	NC_011351	TAAA	2	8	16691	16698	75 %	25 %	0 %	0 %	209395691
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396	NC_011351	AG	3	6	16759	16764	50 %	0 %	50 %	0 %	209395691
397	NC_011351	A	6	6	16825	16830	100 %	0 %	0 %	0 %	209395691
398	NC_011351	ATA	2	6	16867	16872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_011351	TGG	2	6	16931	16936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395643
400	NC_011351	ATG	2	6	16951	16956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395643
401	NC_011351	TGA	3	9	17189	17197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395643
402	NC_011351	TGA	2	6	17213	17218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395643
403	NC_011351	ACA	2	6	17272	17277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395643
404	NC_011351	TCTG	2	8	17441	17448	0 %	50 %	25 %	25 %	209395643
405	NC_011351	TAC	2	6	17526	17531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395643
406	NC_011351	GTG	2	6	17554	17559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395643
407	NC_011351	CGG	2	6	17647	17652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395643
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410	NC_011351	A	7	7	17703	17709	100 %	0 %	0 %	0 %	209395643
411	NC_011351	A	6	6	17782	17787	100 %	0 %	0 %	0 %	209395643
412	NC_011351	CAA	2	6	17802	17807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395643
413	NC_011351	TGA	2	6	17864	17869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395643
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440	NC_011351	ATTG	2	8	18977	18984	25 %	50 %	25 %	0 %	209395643
441	NC_011351	AAC	2	6	18989	18994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395643
442	NC_011351	ATT	2	6	19041	19046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_011351	GGT	2	6	19101	19106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_011351	AT	3	6	19257	19262	50 %	50 %	0 %	0 %	209395688
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452	NC_011351	TA	3	6	19513	19518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_011351	TGTT	2	8	19573	19580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_011351	AT	3	6	19624	19629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011351	TAA	2	6	19638	19643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_011351	GA	3	6	19700	19705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_011351	A	7	7	19821	19827	100 %	0 %	0 %	0 %	209395677
462	NC_011351	AAT	2	6	19881	19886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395677
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465	NC_011351	T	6	6	20087	20092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011351	TGG	2	6	20112	20117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_011351	TCAG	2	8	20244	20251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
469	NC_011351	CTGG	2	8	20318	20325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
470	NC_011351	GGT	2	6	20333	20338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_011351	AGG	3	9	20359	20367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011351	GA	3	6	20389	20394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
473	NC_011351	TCC	2	6	20435	20440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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477	NC_011351	A	7	7	20627	20633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_011351	CGG	2	6	20699	20704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_011351	CTT	2	6	20808	20813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_011351	CGC	2	6	20815	20820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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488	NC_011351	TGC	2	6	20973	20978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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492	NC_011351	GTG	2	6	21183	21188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
493	NC_011351	A	6	6	21213	21218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_011351	AGG	2	6	21259	21264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_011351	ATT	2	6	21386	21391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_011351	TTA	2	6	21462	21467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011351	ATA	2	6	21510	21515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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